Atualizado em 20 de Maio de 2009.
Fiz uma análise de final de ano em 2008 e descobri que uma das expressões que mais trouxe leitores a este blog foi “como usar imagej”. Sendo assim, nada mais promissor que ter um artigo com este título, para que quem procura, encontre exatamente a informação de que precisa.
Como usar o ImageJ?
A resposta para esta pergunta começa por outra pergunta: o que você precisa/quer fazer com o ImageJ?
O ImageJ é um software para processamento e análise de imagens, desenvolvido por Wayne Rasband no National Institute of Mental Health, USA. em Java. Com ele é possível realizar várias tarefas de processamento e análise de imagens. Alguns exemplos do que se pode fazer com ele estão nos tutoriais já publicados aqui no ImageSurvey.
Há ferramentas de ajuste de brilho e contraste, ferramentas de segmentação e análise, medição de distâncias e ângulos, possibilidade de processar e analisar imagens de uma só vez, entre outros.
Este tutorial pretende ser um guia para iniciantes, que contém algumas explicações e muitos links para os recursos que você vai precisar para se tornar um expert em ImageJ (ou só fazer o dever de casa, se este for seu objetivo…)
1. Baixe e instale:
Encontre o arquivo para o seu sistema operacional, baixe e instale.
(updade de 07/07/2009) Se estiver usando Ubuntu, como eu, é só ir em Adicionar/Remover aplicações, pesquisar ImageJ e mandar instalar.
2. Inicie o programa:
Da mesma forma que você faz com todos os outros que estão instalados no seu computador.
Janela principal do ImageJ.
Para quem está acostumado a aplicativos Microsoft, pode parecer estranho um programa abrir apenas um pequeno menu, sem aquela área de trabalho que ocupa a tela toda. Você se acostuma…
3. Abra uma imagem
No menu File, você vai encontrar comandos familiares, como Open… e Open recent. Open Samples abre uma das imagens de exemplo do ImageJ, e Open Next abre a próxima imagem do diretório e fecha a que estiver aberta.
4. Escolha suas armas
Entre os grupos de recursos nativos estão:
- Ferramentas de seleção
- Compatibilidade com vários formatos de imagens, incluindo DICOM, e TIFF
- Ajustes de cor e histograma
- Ferramentas de medição manuais e (algumas) automáticas
- Escala de imagens
- Segmentação
- Processamento de imagens binárias
- Filtros
- Transformada de fourier
Todos os recursos estão acessíveis no menu e alguns tem botões para acesso rápido na barra de ferramentas. É possível automatizar tarefas através das macros, ou usando pilhas de imagens (veja na lista de tutoriais).
Boa parte da interface é auto explicativa, mas existe um help/manual na página oficial do ImageJ.
5. Não é suficiente?
A meu ver o melhor de todos os recursos é o que permite estender o programa: a possibilidade de se escrever plugins!
Onde encontrar plugins:
No wiki do ImageJ – Plugins
Na página oficial – plugins
6. Mais recursos
6.1 Tutoriais do ImageJ no ImageSurvey:
Lista atualizada em 19 de março de 2009:
- Como contar objetos – Parte I
- Como contar objetos – Parte II
- Agrupando imagens em pilhas
- Processamento em lote
- Tutorial ImageJ – medição de área foliar
- Tutorial ImageJ: Macros
- Watershed em imagens binárias, e um exemplo útil com ImageJ
- Como captar imagens para processamento usando sua câmera digital
- Tutorial: Diâmetro de esferas, com ImageJ
- Tutorial ImageJ: como “medir a cor” dos objetos
6.2 Documentação do ImageJ
- Help/Manual oficial do ImageJ
- Wiki da documentação (não tem informação sobre quem é o “dono”).
- Recursos para desenvolvedores
6.3 Fóruns e listas de email:
Lista oficial: Eu assino a lista e acho bastante ativa. Antes de perguntar pesquise o arquivo de emails.
Se alguém souber de alguma lista em português, deixe um comentário.
Mais tutoriais? Assine o RSS feed do ImageSurvey e você recebe assim que forem publicados!
Alguem sabe usar o morphoJ?,e se o imageJ tem alguma semelhança com o MorphoJ
solicito orientações como medir feridas em pacientes diabéticos com ulceras de pressão, vou achar taxa de cicatrização,antes e depois do tratamento, pelo image J e depois levar para tabela do excel
Tenho um interesse particular em usar o programa Image J. Estou tentado verificar a possibilidade do seu uso em avaliações de severidade de doenças em folhas e espigas de trigo. No entanto é um programa que eu não conheço muito bem. Normalmente, as situações que se tem nas folhas e nas espigas são duas colorações bem distintas. Uma afetada pela doença e a outra não. O que eu preciso saber é a área de cada uma dessas duas regiões de maneira precisa e rápida.
Alguém poderia me ajudar?
Olá, gostaria de saber de alguma dica para medir a área de de secção transversa de cortes transversais de aortas de ratos. Gostaria de saber também se o programa define o raio de amostras de círculos imperfeitos?
Obrigado e parabéns pelo blog
Trabalho com cortes transversais de aortas de ratos e gostaria de saber se o programa consegue me definir o raio dessas aortas uma vez que muitos cortes não são círculos perfeitos. Outra coisa, o programa é capaz de calcular a área de secção transversa desses cortes?
Obrigado e parabéns pelo blog
Alguem poderia me dizer como faço para instalar plugins do imagej no Mac OS. Estou tendo a maior difuculdade.