Comentários sobre: Tutorial ImageJ: como “medir a cor” dos objetos http://www.imagesurvey.com.br/2009/05/tutorial-imagej-como-medir-a-cor-dos-objetos/ Processamento de imagens na prática Wed, 08 Feb 2012 14:23:09 +0000 hourly 1 Por: Gabriela Bauermann http://www.imagesurvey.com.br/2009/05/tutorial-imagej-como-medir-a-cor-dos-objetos/comment-page-1/#comment-10621 Gabriela Bauermann Thu, 12 Jan 2012 11:50:58 +0000 http://www.imagesurvey.com.br/?p=1515#comment-10621 Olá Rinaldo! Imagens de feridas são imagens como quaisquer outras... você só tem que decidir quais características vai avaliar nelas (tamanho, cor, textura...), ou seja, tem que decidir qual a pergunta. Quando tiveres a pergunta certa, a resposta fica bem mais fácil! Olá Rinaldo!
Imagens de feridas são imagens como quaisquer outras… você só tem que decidir quais características vai avaliar nelas (tamanho, cor, textura…), ou seja, tem que decidir qual a pergunta. Quando tiveres a pergunta certa, a resposta fica bem mais fácil!

]]> Por: Rinaldo http://www.imagesurvey.com.br/2009/05/tutorial-imagej-como-medir-a-cor-dos-objetos/comment-page-1/#comment-10411 Rinaldo Wed, 28 Dec 2011 12:46:06 +0000 http://www.imagesurvey.com.br/?p=1515#comment-10411 Bom dia!!! que legal este blog!!!! Queria saber se é possível trabalhar com esta ferramenta para avaliar imagens de feridas???? Estou pensando em meu trabalho de pós doutorado em Portugal. abraços, Rinaldo. Bom dia!!! que legal este blog!!!! Queria saber se é possível trabalhar com esta ferramenta para avaliar imagens de feridas???? Estou pensando em meu trabalho de pós doutorado em Portugal. abraços, Rinaldo.

]]> Por: Gabriela Bauermann http://www.imagesurvey.com.br/2009/05/tutorial-imagej-como-medir-a-cor-dos-objetos/comment-page-1/#comment-9543 Gabriela Bauermann Thu, 17 Nov 2011 16:36:01 +0000 http://www.imagesurvey.com.br/?p=1515#comment-9543 Camila, é claro que os valores ficam diferentes! Uma imagem de 8bits só tem um canal de cor equando uma rgb tem 3 canais. Agora, para saber de qual das duas você precisa, vai ter que decidir qual é a informação mais útil prá você. Ou você copia alguém que já fez (pesquisa no google por trabalhos com objetivos semelhantes ao seu) ou você estuda sobre cores e histograma (na biblioteca). Até mais! Camila, é claro que os valores ficam diferentes!
Uma imagem de 8bits só tem um canal de cor equando uma rgb tem 3 canais.
Agora, para saber de qual das duas você precisa, vai ter que decidir qual é a informação mais útil prá você. Ou você copia alguém que já fez (pesquisa no google por trabalhos com objetivos semelhantes ao seu) ou você estuda sobre cores e histograma (na biblioteca).
Até mais!

]]> Por: Camila http://www.imagesurvey.com.br/2009/05/tutorial-imagej-como-medir-a-cor-dos-objetos/comment-page-1/#comment-9118 Camila Mon, 31 Oct 2011 22:20:35 +0000 http://www.imagesurvey.com.br/?p=1515#comment-9118 ola gostaria de saber se para quantificar a intensidade da fluorescencia verde olhando pelo histograma a imagem tem que estar em 8 bit ou rgb??? pq os valores ficam bem diferentes quando muda de 8bit para rgb. Obrigada Camila ola

gostaria de saber se para quantificar a intensidade da fluorescencia verde olhando pelo histograma a imagem tem que estar em 8 bit ou rgb??? pq os valores ficam bem diferentes quando muda de 8bit para rgb.

Obrigada

Camila

]]> Por: alex http://www.imagesurvey.com.br/2009/05/tutorial-imagej-como-medir-a-cor-dos-objetos/comment-page-1/#comment-8805 alex Tue, 18 Oct 2011 12:28:42 +0000 http://www.imagesurvey.com.br/?p=1515#comment-8805 Bom dia gabriela, recentemente você me forneceu uma saída para o meu problema. Segue abaixo sua sugestão. Entranto não consigo executa-la. Terial algum tutorial para poder seguir? Obrigado Alex Minha sugestão é a seguinte: - Scaneie (esta palavra existe?) também um papel que não foi pulverizado - com um grupo de controle. - recorte em todas as imagens somente a área de interesse (a pulverizada) - depois separe em canais (não sei se RGB, HSV ou outro sistema) tanto as amostras quanto o controle. - então compare cada amostra com a original, usando uma função de subtração ou diferença (tem que testar e ver qual funciona melhor) - destas imagens resultado (controle - amostraX) você pode extrair algumas informações estatísticas em cada canal de cor (média, desvio-padrão, por exemplo) dos valores dos pixels. Isto vai ser seu resultado. Bom dia gabriela, recentemente você me forneceu uma saída para o meu problema. Segue abaixo sua sugestão. Entranto não consigo executa-la. Terial algum tutorial para poder seguir?

Obrigado

Alex

Minha sugestão é a seguinte:
- Scaneie (esta palavra existe?) também um papel que não foi pulverizado – com um grupo de controle.
- recorte em todas as imagens somente a área de interesse (a pulverizada)
- depois separe em canais (não sei se RGB, HSV ou outro sistema) tanto as amostras quanto o controle.
- então compare cada amostra com a original, usando uma função de subtração ou diferença (tem que testar e ver qual funciona melhor)
- destas imagens resultado (controle – amostraX) você pode extrair algumas informações estatísticas em cada canal de cor (média, desvio-padrão, por exemplo) dos valores dos pixels. Isto vai ser seu resultado.

]]> Por: Gabriela Bauermann http://www.imagesurvey.com.br/2009/05/tutorial-imagej-como-medir-a-cor-dos-objetos/comment-page-1/#comment-6838 Gabriela Bauermann Fri, 05 Aug 2011 11:13:29 +0000 http://www.imagesurvey.com.br/?p=1515#comment-6838 Olá Luciano, Você acabou de descrever a operação de <a href="http://www.imagesurvey.com.br/2008/09/threshold-simples-e-funciona-mas-nao-para-todos/" rel="nofollow">Threshold</a>. O problema é que pelo que eu conheço deste tipo de imagens, esses núcleos nunca ficam <strong>muito mais corados que o resto</strong>, então pode ser que não fique tão bom. Já vi dar certo usando <a href="http://www.imagesurvey.com.br/2010/05/mean-shift-segmentacao-em-cores/" rel="nofollow">mean-shift</a>... Boa sorte e até mais! Olá Luciano,
Você acabou de descrever a operação de Threshold. O problema é que pelo que eu conheço deste tipo de imagens, esses núcleos nunca ficam muito mais corados que o resto, então pode ser que não fique tão bom. Já vi dar certo usando mean-shift…
Boa sorte e até mais!

]]> Por: Luciano Duarte http://www.imagesurvey.com.br/2009/05/tutorial-imagej-como-medir-a-cor-dos-objetos/comment-page-1/#comment-6679 Luciano Duarte Thu, 28 Jul 2011 20:00:19 +0000 http://www.imagesurvey.com.br/?p=1515#comment-6679 Olá Gabriela. Seu comentários são ótimos. Trabalho com raspados de células corados com Papanicolaou. Gostaria de saber se é possivel, analisar a cor roxa, de nucleos corados, determinando um padrão normal e pedir ao imagej para marcar tudo o que for roxo mais intenso do que o núcleo que eu nomeei como normal. Olá Gabriela. Seu comentários são ótimos.
Trabalho com raspados de células corados com Papanicolaou. Gostaria de saber se é possivel, analisar a cor roxa, de nucleos corados, determinando um padrão normal e pedir ao imagej para marcar tudo o que for roxo mais intenso do que o núcleo que eu nomeei como normal.

]]> Por: Gabriela Bauermann http://www.imagesurvey.com.br/2009/05/tutorial-imagej-como-medir-a-cor-dos-objetos/comment-page-1/#comment-4511 Gabriela Bauermann Fri, 11 Feb 2011 15:19:53 +0000 http://www.imagesurvey.com.br/?p=1515#comment-4511 Olá Alex, Parece interessante seu trabalho... quais passos exatamente você não conseguiu executar? Existe um limite claro entre o azul e o amarelo das suas imagens? Eles são realmente diferentes ou se confundem de alguma forma? Se você converter sua imagem para tons de cinza ainda consegue enxergar as duas cores? Se separar em canais ("split channels") há algum canal em que se vê mais diferença entre suas duas cores? Olá Alex,
Parece interessante seu trabalho… quais passos exatamente você não conseguiu executar?
Existe um limite claro entre o azul e o amarelo das suas imagens? Eles são realmente diferentes ou se confundem de alguma forma? Se você converter sua imagem para tons de cinza ainda consegue enxergar as duas cores? Se separar em canais (“split channels”) há algum canal em que se vê mais diferença entre suas duas cores?

]]> Por: Alex Sandro http://www.imagesurvey.com.br/2009/05/tutorial-imagej-como-medir-a-cor-dos-objetos/comment-page-1/#comment-4509 Alex Sandro Fri, 11 Feb 2011 11:58:08 +0000 http://www.imagesurvey.com.br/?p=1515#comment-4509 Gabriela, bom dia! Faz 24 horas que entrei em contato com o imageJ e estou apanhando com o programa, mas chego lá. Estou gostando bastante. Bom, vamos ao meu problema. Estamos avaliando a pulverização de inseticidas sobre cartões hidrosensíveis comparando dois pulverizadores. Basicamente estas avaliações são feitas pulverizando o inseticida (usei água) sobre papel hidrosensível. Este papel é amarelo e a parte que entra em contato com a água fica azul. Após as pulverizações, escaneei os cartões em 600 dpi e salvei com a extensão Tiff. Entretanto não consigo efetuar alguns passos do seu tutorial “medir a cor dos objetos”, pois a intenção é relacionar a cor azul (área atingida pela água) com a área amarela (não atingida) e comparar as pulverizações dos dois pulverizadores. Se você puder me ajudar nisto, fico MUITO agradecido. Alex Gabriela, bom dia!

Faz 24 horas que entrei em contato com o imageJ e estou apanhando com o programa, mas chego lá. Estou gostando bastante. Bom, vamos ao meu problema. Estamos avaliando a pulverização de inseticidas sobre cartões hidrosensíveis comparando dois pulverizadores.

Basicamente estas avaliações são feitas pulverizando o inseticida (usei água) sobre papel hidrosensível. Este papel é amarelo e a parte que entra em contato com a água fica azul.

Após as pulverizações, escaneei os cartões em 600 dpi e salvei com a extensão Tiff. Entretanto não consigo efetuar alguns passos do seu tutorial “medir a cor dos objetos”, pois a intenção é relacionar a cor azul (área atingida pela água) com a área amarela (não atingida) e comparar as pulverizações dos dois pulverizadores. Se você puder me ajudar nisto, fico MUITO agradecido.

Alex

]]> Por: Gabriela Bauermann http://www.imagesurvey.com.br/2009/05/tutorial-imagej-como-medir-a-cor-dos-objetos/comment-page-1/#comment-4267 Gabriela Bauermann Mon, 08 Nov 2010 19:20:42 +0000 http://www.imagesurvey.com.br/?p=1515#comment-4267 Olá, Jenifer! Isto me lembra que eu preciso escrever um post sobre histogramas... o que tem por aí é sofrível! Bom, vou tentar te explicar em poucas palavras, mas fique atenta ao próximo post, que eu acho que vai ser sobre histogramas. - cada pixel da imagem é representado por 3 valores (um para vermelho (red) outro para verde e outro para o azul). As cores que você vê na tela são sempre uma combinação entre estes três valores. Portanto, o histograma não pode ser lido assim da maneira que você está interpretando. - o histograma mede quantos píxels têm o valor zero em vermelho, quantos tem valor um em vermelho, etc. (a unidade é a quantidade de pixels). - para quantificar cores, use este método: http://www.imagesurvey.com.br/2009/05/tutorial-imagej-como-medir-a-cor-dos-objetos/ Boa sorte, e até mais! Olá, Jenifer!
Isto me lembra que eu preciso escrever um post sobre histogramas… o que tem por aí é sofrível!
Bom, vou tentar te explicar em poucas palavras, mas fique atenta ao próximo post, que eu acho que vai ser sobre histogramas.
- cada pixel da imagem é representado por 3 valores (um para vermelho (red) outro para verde e outro para o azul). As cores que você vê na tela são sempre uma combinação entre estes três valores. Portanto, o histograma não pode ser lido assim da maneira que você está interpretando.
- o histograma mede quantos píxels têm o valor zero em vermelho, quantos tem valor um em vermelho, etc. (a unidade é a quantidade de pixels).
- para quantificar cores, use este método: http://www.imagesurvey.com.br/2009/05/tutorial-imagej-como-medir-a-cor-dos-objetos/

Boa sorte, e até mais!

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