Comentários sobre: Tutorial ImageJ – usando seleção manual e ROI Manager

Por: Gabriela Bauermann

Gabriela Bauermann — Tue, 25 May 2010 11:36:42 +0000

Olá Tatiana!
Na verdade não sabia o que era isso até você perguntar… mas perguntei ao Google, e ele me mostrou este post:
http://lukemiller.org/journal/2007/08/quantifying-western-blots-without.html
Espero que ajude!

Por: Tatiana de Melo

Tatiana de Melo — Tue, 25 May 2010 00:56:08 +0000

Olá. Eu gostaria de saber se você teria dicas de como utilizar o image J para fazer densitometrias de bandas por Western blotting. Obrigada!

Por: Diego Sangiorgi

Diego Sangiorgi — Tue, 16 Mar 2010 18:02:00 +0000

Cara Gabriela fico muito feliz em saber que minhas duvidas e imagens foram uteis para criar este conhecimento e auxiliar mais pessoas! Este metodo funcionou muito bem para o que eu precisava. Obrigado

Por: Gabriela Bauermann

Gabriela Bauermann — Fri, 06 Nov 2009 16:17:59 +0000

Hugo,
Ótima observação. Pode ser que somar os canais dê melhores resultados em alguns casos, assim como usar outros espaços de cor, e não tem como saber a resposta a priori. Neste caso, optei pelo azul porque visualmente ele era o que mais variava.
Mas isso não vale sempre. Cada caso tem que ser analisado em separado. Sempre é bom fazer um teste piloto com uma pequena quantidade de amostras para decidir o melhor caminho.

Por: Hugo Torres

Hugo Torres — Fri, 06 Nov 2009 14:21:53 +0000

Cara Gabriela,

Seus tutoriais continuam muito bons! Continue nos alimentando =]

Esse problema dos canais de cores foi uma dúvida que tive em meu trabalho também. Pergunto se não seria mais adequado em um trabalho de densitometria ótica (quando se converte os valores de cinza médio em valores de densidade ótica) medir os valores de cinza da imagem de 8bits com valores médios de cada canal ([vermelho + verde +azul]/3).

De outra forma a pergunta é, porque o canal azul é mais importante que os outros?

Consigo antever que ao fazer a média de intensidades dos três canais de uma marcação molecular – um pigmento ou uma cor – que só varie no canal azul, você diluiria o aumento. Mas como saber a priori em que canal sua intensidade varia mais? No caso apresentado nesse artigo por exemplo você diz que “o verde tem bastante azul” então eu presumo que seja composto um pouco de vermelho e/ou verde também.