Tag: ImageJ
Usando escala pré-definida em microscopia ótica digital
Antigamente, quando os microscópios não tinham câmeras digitais, e era usado só para observar a imagem, o aumento (10 vezes, 1000 vezes, etc) era suficiente para estabelecer uma ideia de escala. Essa ideia de escala era mais usada como ideia mesmo, e não se media tanto as estruturas observadas como se mede hoje. Mas agora [...]
Segmentação de Ácinos
Este post é uma análise de tentativas, não uma solução. Nele discuto algumas opções para resolver um problema de segmentação bem difícil, em uma lâmina de ácinos. Mas… o que são ácinos? Bom, eu também tive que perguntar: são “pequenas cavidades glandulares arredondadas, em forma de fundo-de-saco, que desemboca num canal excretor. Pode ser alveolar, [...]
Diâmetro de Feret
Diâmetro de Feret é uma medida que ganhou importância na análise de partículas durante os últimos… 80 anos, pelo menos. É uma forma de caracterizar tamanho, que não depende da posição do objeto na imagem. Apesar da definição aparentemente simples, a evolução do conceito criou um conjunto de medidas. Feret Máximo e Feret Mínimo passaram [...]
Mean-shift: segmentação em cores
Mean-shift é um método de segmentação baseado em cores, ou seja, no caráter multidimensional das imagens coloridas. Hoje vou mostrar um exemplo de uso, com um plugin do ImageJ. A teoria toda não cabe num post, por isso deixo para mais adiante.
Problema do mundo real: pinos dentários em microscopia eletrônica
Uma leitora me enviou uma imagem na semana passada, perguntando como resolver um problema de segmentação. Ela permitiu o uso da imagem neste post, por isso, mãos à obra! Trata- se de uma imagem obtida por microscopia eletrônica, de um pino dentário. Não pude automatizar a solução do problema, mas a análise e a solução [...]
E 2009 já acabou!
Tempo de retrospectivas – vou fazer a minha também, só para não perder o costume. 2009 foi um ótimo ano para mim (pessoal e profissionalmente) e para o blog também. Adorei receber muitas consultas sobre como fazer coisas com imagens interessantes. Algumas consultas deram em post, outras me trouxeram novos amigos. Vamos ver como foi [...]
ImageJ evolution!
Hoje pela manhã recebi um email da lista de usuários do ImageJ que achei que merece mais que um twitt. Ele trouxe a notícia de que um grupo de importantes desenvolvedores oficiais e [antes] não oficiais do ImageJ estruturaram, em conjunto, uma proposta sólida para a continuidade e evolução do software. E mais: conseguiram apoio [...]
Tutorial ImageJ – usando seleção manual e ROI Manager
Recebi recentemente um email de um leitor deste blog, Diego Sangiorgi, que precisava quantificar o crescimento de algas em uma placa de petri usando a cor da imagem. Depois de encontrar a solução, obtive dele a permissão para usar as imagens neste tutorial. Para medir o crescimento das algas vou usar algumas ferramentas do ImageJ [...]
