Tag: tutorial
Os Ecólogos também podem usar o poder dos softwares!
Hoje é a vez de um leitor contar como se livrou do papel milimetrado e fez o trabalho todo em bem menos tempo, usando usando o ImageJ. Eduardo me enviou este passo a passo para dividir com outras pessoas o que ele aprendeu – tem umas dicas legais de como usar as ferramentas disponíveis no [...]
Contador manual de células
Como programadora e adepta de métodos automáticos, sempre evitei saídas que exigem interação com o usuário. Mas tem situações em que ainda não chegamos, com os algorítimos, aonde nossos bem treinados olhos chegaram… Para a minha surpresa, muitos usuários não têm problemas com isso – eles aceitam interagir com cada imagem, desde que o programa [...]
Mean-shift: segmentação em cores
Mean-shift é um método de segmentação baseado em cores, ou seja, no caráter multidimensional das imagens coloridas. Hoje vou mostrar um exemplo de uso, com um plugin do ImageJ. A teoria toda não cabe num post, por isso deixo para mais adiante.
Como eu comecei a usar a JAI
Enquanto o blog estava em férias, eu estava trabalhando em um projeto da minha empresa. Neste projeto optamos por usar a JAI num aplicativo de análise de imagens. Eu já conhecia, mas nunca tinha programado com esta biblioteca, aí tive que aprender por onde começar. É isto que vou contar aqui. A JAI Java Advanced [...]
Crescimento de Regiões usando Fiji
Dizem que o ano só começa mesmo depois do carnaval… então vamos começar o ano! Hoje estou mais para tutorial, então vou usar um exemplo e vamos ver como funciona o algoritmo de crescimento de regiões implementado no Fiji, por Johannes Schindelin.
Tutorial ImageJ – usando seleção manual e ROI Manager
Recebi recentemente um email de um leitor deste blog, Diego Sangiorgi, que precisava quantificar o crescimento de algas em uma placa de petri usando a cor da imagem. Depois de encontrar a solução, obtive dele a permissão para usar as imagens neste tutorial. Para medir o crescimento das algas vou usar algumas ferramentas do ImageJ [...]
Detecção de bordas – Sobel
Venho ensaiando um post sobre detecção de bordas há algum tempo, mas ele acaba ficando para depois por dois motivos: primeiro porque é um tema enorme, segundo porque o ImageJ não é muito bom nisso. Resolvi começar, e vamos ver aonde consigo chegar em um post.
Plugins do ImageJ no Ubuntu
Tive um certo trabalho para descobrir como instalar plugins do ImageJ no Ubuntu. Não que seja difícil, mas o google não me ajudou! Por isso resolvi escrever este artigo, que vai repetir as palavras ImageJ e Umbutu várias vezes (para o google poder ajudar as outras pessoas que tiverem a mesma dificuldade), e contar como [...]
